同仁医院并没有实施HR系统中的关键模块—合同管理模块和工资管理模块。这是因为充分考虑到对医院原有系统的应用和医院人力资源管理的特殊性。
首先，在我国医院的人力资源管理中实行特殊的双聘制，即全员聘用制和岗位聘任制。这是一般合同管理模块很难解决的问题。因此，同仁医院决定在eHR系统之上定制开发双聘的功能节点。
其次，同仁医院自身的信息化建设基础比较好，医院自己的开发人员已经根据自身的情况研发了“工资管理系统”，应用情况非常好。重建HR系统后，用友公司与同仁医院信息中心合作开发了两系统之间的接口程序，实现了两套系统的数据整合和共享。
在医院最为基础、同时也是最为关键的员工管理上，同仁医院通过权限管理的应用，在保证信息准确性的同时，又保证了信息的实时更新。比如说，像职工专业技术职务、员工的学历、聘任情况等重要信息，只有人事处才有权限根据实际情况进行更改；而像执业医师资格、手术权限、导师情况、社团任职等信息，都需要其他相关职能部门进行维护；像家庭地址、联系电话等非关键信息，员工在客户端就可以修改了。
建立服务全院的eHR到目前为止，在同仁医院和用友公司的共同努力下，同仁医院HR系统已经成功实施，并且已经初见成效。
首先，形成了统一的、全面的、标准化的员工信息库。通过B/S技术的应用，同仁医院已经将3个区人员整合成一个统一的员工信息库。员工信息整合了旧HR系统的花名册的优点，并进行了功能扩展。比如说增加了查询等功能，使得各相关部门使用起来非常方便。员工信息的采集和使用，是医院人事管理的一大课题。这一问题的解决，也是同仁医院eHR系统应用的一大亮点，为同仁医院的管理减轻了很多负担。
其次，网络化的应用使人员调配变得更加容易。过去在同仁医院要进行人员调配的时候，需要有一个审核过程，要拿着审核单到各个职能处室会签。而同仁医院一院三址，分为位于崇文门的老院、东院和亦庄开发区的南院，会签就变得更加麻烦。现在通过系统的会签功能，人员的调配直接在网上就可以实现了。
另外，定制的流程化双聘流程，大大减少了人员信息的维护量。与原有系统之间的接口，有效防止了信息传递的失误与偏差。
再次，经理自助功能让管理人员的工作变得轻松。医院的管理层中，除了职能部门有专职人员，其他科室主任大部分都是医疗专家兼任的。科室主任本身可能还是学科带头人或临床专家，需给病人看病，还要兼管行政或者教学。可见，如果不能给他们提供一个很好的平台或者工具，管理起来就会非常费劲。通过经理自助功能，科室主任可看到本科室人员信息，完成对本科室人员的管理。特别是整合后的员工信息，让科室主任能够非常轻松地决定是否有权利来做某件事情，而无须去各个相关部门确认。据魏勤介绍，同仁医院每个科室员工都很多，比如说眼科的大夫就有200多人。以前如果科室主任需要了解本科室所有中级职称的人员，就需要查科室的员工表，然后找秘书来统计，或者去人事处找单机版的系统来查看，容易造成人为的错误。而现在，科室主任在自己的电脑上使用医院的eHR系统，就可以一目了然了。
对于下一步的工作，王霞表示，他们将更多地跟各个职能部门沟通，把系统设计的思路灌输给应用部门，让系统真正能够被用起来，发挥其作用。同时，据了解，同仁医院还将在此基础上启动二期工程，将绩效考核等人力资源管理工作通过系统来实现。
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